Institut für Pharmazeutische Chemie -
Prof. Dr. Michael Karas

 

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Expertise

  • Proteomics: Identifizierung und Charakterisierung von Proteinen aus Zellen oder Zellkompatimenten
  • Massenspektrometrie (ESI und MALDI) von intakten Proteinen, Peptiden, Oligosacchariden, Arzneimitteln und Metaboliten
  • Verfahrensentwicklung zur Untersuchung von Membranproteinen und Membranprotein- Komplexen
  • In-vitro Assay für Transkription/Translation für die Suche nach neuen Inhibitoren der bakteriellen Proteinsynthese (Antibiotika)
  • Verfahrensentwicklung in der Wirkstoffanalytik
  • Flüssig-Chromatographie (HPLC)
  • Gel Elektrophorese

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Methoden und Geräte

  • 1D/2D-Gel-Electrophorese
  • Blau-native Gel-Elektrophorese
  • MALDI TOF Massenspektrometrie
  • MALDI TOF-TOF Massenspektrometrie
  • Nano-ESI-MS
  • HPLC-ESI-MS/MS
  • µ-bore, Kapillar- und nano-HPLC
  • TAP Tandem-Affinitätsaufreinigung zur Untersuchung funktioneller Multi-Protein Komplexe

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Mitarbeiter:

  • Dr. Ute Bahr (Protein MS, Oligosaccharid MS, Oligonukleotid-MS))
  • Apothekerin Sabrina Baltruschat (Proteomics)
  • Dipl. Ing. Tobias Beckhaus (Proteomics)
  • Apothekerin Sandra Bornemann (Proteomics)
  • Dipl. Chemiker Thorsten Jaskolla (Grundlagen zum MALDI-Prozess)
  • Apotheker Björn Meyer (Proteomics, Membranproteine)
  • Dipl. Biologe Malte Schürken (Proteomics, Membranproteine)

 

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Publications

  • Weidlich M, Klammt C, Bernhard F, Karas M, Stein T: Differential activity profiles of translation inhibitors in whole-cell and cell-free approaches. Lett Appl Microbiol 2008; 46: 155-159.
  • Meyer B, Wittig I, Karas M, Schägger H: Identification of two proteins associated with mammalian ATP synthase. Mol Cell Proteomics 2007; 6: 1690-1699.
  • Petri J, Kaunzinger A, Niemöller A, Karas M: Quality control of tablets by Near Infrared (NIR)-Spectroscopy. Pharmazie 2005; 60: 743-746.
  • Hofmann S, Glückmann M, Kausche S, Schmidt A, Corvey C, Lichtenfels R, Huber C, Albrecht C, Karas M, Herr W: Rapid and sensitive identification of major histocompatibility complex class I-associated tumor peptides by nanoLC MALDI MS/MS mass spectrometry. Mol Cell Proteomics 2005; 4: 1888-1897.
  • Fandino AS, Rais I, Vollmer M, Elgass H, Schägger H, Karas M: LC-nanospray-MS/MS analysis of hydrophobic proteins from membrane protein complexes isolated by blue-native electrophoresis. J Mass Spectrom 2005; 40: 1223-1231.
  • Corvey C, Stein T, Kötter P, Entian KD, Karas M: Carbon source dependent assembly of the Snf1p kinase complex in Candida albicans. J Biol Chem 2005; 280: 25323-25330.
  • Fandino AS, Rais I, Vollmer M, Elgass H, Schägger H, Karas M: LC-nanospray-MS/MS analysis of hydrophobic proteins from membrane protein complexes isolated by blue-native electrophoresis. J Mass Spectrom 2005; 40: 1223-1231.
  • Hofmann S, Glückmann M, Kausche S, Schmidt A, Corvey C, Lichtenfels R, Huber C, Albrecht C, Karas M, Herr W: Rapid and sensitive identification of major histocompatibility complex class I-associated tumor peptides by nanoLC MALDI MS/MS mass spectrometry. Mol Cell Proteomics 2005; 4: 1888-1897.
  • Aivaliotis M, C. Corvey, I. Tsirogianni, M. Karas, G: Tsiotis Membrane proteome analysis of the green-sulfur bacterium Chloropium tepidum Electrophoresis 25 2004; 3468-3474.
  • Dörrschuck A, Schmidt A, Schnürer E, Glückmann M, Albrecht C, Wölfel C, Lennerz V, Lifke A, Di Natale C, Ranieri E, Huber C, Karas M, Herr W: CD8+ cytotoxic T lymphocytes isolated from allogeneic healthy donors recognize HLA-class Ia/Ib-associated renal carcinoma antigens with ubiquitous or restricted tissue expression. Blood 2004; 104: 2591-2599.
  • Rais I, Karas M, Schägger H: Two-dimensional gel elctrophoresis for the isolation of integral membrane proteins and mass spectrometric identification Proteomics 2004; 4: 2567-2571.
  • Keller JH, Karas M, Müller WE, Volmer DA, Eckert GP, Abdel-Tawab M, Blume HH, Dingermann T, Schubert-Zsilavecz M: Determination of Hyperforin in Mouse Brain by Rapid High Performance Liquid chromatography/Tandem Mass Spectrometry. Anal Chem 2003; 75: 6084-6088.
  • Ekroos K, Ejsing CS, Bahr U, Karas M, Simons K, Shevchenko A: Charting molecular composition of phosphatidylcholines by fatty acid scanning and ion trap MS3 fragmentation. J Lipid Res 2003; 44: 2181-2192.
  • Corvey C, Stein T, Düsterhus S, Karas M, Entian KD: Activation of subtilin precursors by Bacillus subtilis extracellular serine proteases subtilisin (AprE), WprA, and Vpr. Biochem Biophys Res Commun 2003; 304: 48-54.
  • Krüger R, Karas M: Ion Formation in MALDI: The Cluster Ionization Mechanism. Chem Rev 2003; 103: 427-439.
  • Schmidt A, Dülks T, Karas M: Effect of different solution flow rate on analyte ion signals in nano-ESI MS, or : When does ESI turn to Nano-ESI? J Am Soc Mass Spectrom 2003; 14: 492-500.
  • Pfenninger A, Karas M, Finke B, Stahl B: Structural Analysis of Underivatized Neutral Human-Milk Oligosaccharides in the Negative Ion Mode by Nano-Electrospray MSn (Part 2 : Application to Isomeric Mixtures.). J Am Soc Mass Spectrom 2002; 13: 1341-1348.
  • Pfenninger A, Karas M, Finke B, Stahl B: Structural Analysis of Underivatized Neutral Human-Milk Oligosaccharides in the Negative Ion Mode by Nano-Electrospray MSn (Part 1 : Methodology). J Am Soc Mass Spectrom 2002; 13: 1331-1340.
  • Schmidt A, Karas M: The influence of Electrostatic Interactions on the Detection of Heme-Globin Complexes in ESI-MS J. Am. Soc. Mass Spectrom 2001; 12: 1092-1098.
  • Schmidt A, Bahr U, Karas M: The Influence of Pressure in the First Pumping Stage on Analyte Desolvation and Fragmentation in Nano-ESI MS. Anal Chem 2001; 73: 6040-6046.
  • Abdel Tawab M, Bahr U, Danieli B, Gebhardt S, Karas M, Riva S, Schubert-Zsilavecz M: Electrospray Mass Spectrometry with Consecutive Fragmentation Steps (ES-MSn) as a Tool for Rapid and Sensitive Analysis of Ginsenosides and their Galactosyl Derivatives. Helv Chim Acta 2000; 83: 739-747.
  • Finke B, Stahl B, Pfenninger A, Karas M, Daniel H, Sawatzki G: Analysis of High-Molecular-Weight Oligosaccharides from Human Milk by Liquid Chromatography and MALDI-MS. Anal Chem 1999; 71: 3755-3762.
  • Bahr U, Karas M: Differentiation of "Isobaric" Peptides and Human Milk Oligosaccharides by Exact Mass Measurements Using ESI-orthogonal TOF Analysis. Rapid Commun Mass Spectrom 1999; 13: 1052-1058.
  • Hillenkamp F, Karas M, Beavis RC, Chait BT: Matrix- Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry of Biopolymers. Anal Chem 1991; 63: 1193A -1203A.

   

 

 

INSTITUTE UND MEDIZINISCHE ZENTREN

 
Chemie

Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie

Prof. Dr. Joachim W. Engels

Prof. Dr. Michael Göbel

Prof. Dr. Gisbert Schneider

Pharmazie

Institut für Pharmazeutische Biologie

Prof. Dr. Theo Dingermann

Prof. Dr. Rolf Marschalek

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Institut für Pharmazeutische Chemie

Prof. Dr. Michael Karas

Prof. Dr. Manfred Schubert-Zsilavecz

Prof. Dr. Holger Stark

Prof. Dr. Dieter Steinhilber

Institut für Pharmazeutische Technologie

Prof. Dr. Jennifer Dressman

Prof. Dr. Jörg Kreuter

Pharmakologisches Institut für Naturwissenschaftler

Prof. Dr. Jochen Klein

Prof. Dr. Walter E. Müller

Gustav-Embden-Zentrum für Biologische Chemie

Institut für
Biochemie I: Pathobiochemie

Prof. Dr. Bernhard Brüne

Zentrum der Hygiene

Medizinische Virologie

Prof. Dr. Hans Wilhelm Doerr

Dr. Senckenbergische Anatomie

Anatomie I: Klinische Neuroanatomie

Prof. Dr. Thomas Deller

Anatomie II: Experimentelle Neurobiologie

Prof. Dr. Horst-Werner Korf

Zentrum der Pharmakologie

Allgemeine Pharmakologie und Toxikologie

Prof. Dr. Josef Pfeilschifter

Immunpharmakologie

Prof. Dr. Heinfried Radeke

Klinische Pharmakologie

Prof. Dr. Dr. Gerd Geißlinger

Zentrum der Physiologie

Physiologie I: Kardiovaskuläre Physiologie

Prof. Dr. Ralf Brandes

Institute for Vascular Signalling

Prof. Dr. Ingrid Fleming

Zentrum für Gesundheits-
wissenschaften

Allgemeinmedizin

Prof. Dr. Ferdinand Gerlach

Zentrum der Anästhesiologie und Wiederbelebung

Anästhesiologie, Intensivmedizin und Schmerztherapie

Prof. Dr. Oliver Habler

Prof. Dr. Paul Kessler

Zentrum der Chirurgie

Klinik für Allgemeinchirurgie

Prof. Dr. Wolf O. Bechstein

Dr. Christiane Gog

Dr. Christoph W. Strey

PD Dr. Christoph Wullstein

Mund-, Kiefer- und Plastische Gesichtschirurgie

Prof. Dr. Dr. Dr. Robert Sader

Zentrum der Dermatologie und Venerologie

Klinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie

Prof. Dr. Roland Kaufmann

Zentrum der Frauenheilkunde und Geburtshilfe

Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe

Prof. Dr. Manfred Kaufmann

Zentrum der Inneren Medizin

Med. Klinik I: Gastroenterologie und Hepatologie, Pneumologie und Allergologie, Endokrinologie und Diabetologie sowie Ernährungsmedizin

Prof. Dr. Christoph Sarrazin

PD Dr. Dr. Oliver Schröder

Prof. Dr. Gerlinde Teuber

Prof. Dr. Stefan Zeuzem

Med. Klinik II: Hämatologie / Onkologie, Rheumatologie, Infektiologie, Therapie der HIV - Erkrankung

Prof. Dr. Harald Burkhardt

Prof. Dr. Hubert Serve

Zentrum für Kinder- und Jugendmedizin

Klinik I: Stoffwechsel, Endokrinologie, Gastroenterologie, Ernährung, Pneumologie, Allergologie, Infektiologie, Neurologie und Neonatologie

Prof. Dr. Hansjosef Böhles

Prof. Dr. Stefan Zielen

Klinik für Pädiatrische Hämatologie, Onkologie und Hämostaseologie

Prof. Dr. Peter Bader

Prof. Dr. Thomas Klingebiel

Dr. Ulrike Köhl

Prof. Dr. Thomas Lehrnbecher

Prof. Dr. Dirk Schwabe

Zentrum der Neurologie und Neurochirurgie

Klinik für Neurologie

Prof. Georg Auburger

Prof. Rüdiger Hilker

Dr. H. Laufs

Dr. Matthias Lorenz

PD Dr. N. Müller

Prof. Dr. T. Neumann-Haefelin

Prof. Dr. Helmuth Steinmetz

Prof. Dr. Ulf Ziemann

Zentrum der Radiologie

Institut für Diagnostische und Interventionelle Radiologie

Prof. Dr. Thomas Vogl

Institut für Neuroradiologie

Prof. Dr. Friedhelm Zanella

Klinik für Nuklearmedizin

Prof. Dr. Frank Grünwald